南通住房公积金办理流程如下：

1.申请人需要准备相关材料，包括身份证件、银行卡、公积金账号和申请表。

2.持着这些材料前往公积金管理中心，找到相关的办理窗口。

3.在窗口，申请人将被要求填写一份公积金的申请表，并且需要提供身份证原件和复印件、银行卡原件和复印件以及公积金账号。

4.完成申请表之后，申请人需要将所有的材料交给工作人员，并等待工作人员的审核。

5.审核通过后，申请人将被告知办理时间等。

6.然后，申请人需要前往指定的银行，办理公积金手续。

7.在银行，申请人需要出示身份证原件和复印件、银行卡原件和复印件，然后填写公积金的申请表。

8.银行工作人员会核对申请表和身份信息，并将处理。

具体的办理时间因地区和银行的不同而有所差异。完成办理后，申请人可以通过银行账户查看情况，并使用。